Layanan Pengujian di Balai Pengujian Standar Instrumen Lingkungan Pertanian memiliki Laboratorium Pengujian yang sudah Terakreditasi KAN ISO/SNI 17025.
Laboratorium melayani pengujian sebagai berikut:
| Jenis Layanan | Komponen Layanan |
| Laboratorium Pestisida | Pengujian mutu pestisida pada produk pestisida, serta residu pestisida pada tanah, air, komoditas kering, komoditas dengan kadar air tinggi, dan komoditas dengan kadar asam tinggi (Organoklorin, Organofosfat, Karbamat, Piretroid, Herbisida, Pestisida Nabati) |
| Laboratorium Logam Berat | Analisa Kimia Tanah, Analisa Kimia Tanaman, Analisa Kimi Air/Limbah Cair, Analisa Kimia Pupuk Anorganik, Analisa Kimia Pupuk Organik |
| Laboratorium Gas Rumah Kaca | Gas CH4, Gas CO2, N2O |
| Laboratorium Mikrobiologi | Total Bakteri/TPC |